根据我所知，急诊室故事中窦芽儿最后成功地进行了手术，但手术过程中遇到了一些困难和意外，包括手术室电源故障和医生手误等情况。尽管如此，经过医生们的共同努力，最终窦芽儿的手术成功完成，她也开始了康复治疗。