是的，朴朴配送箱会进行消毒处理。在疫情期间，为了确保用户在使用朴朴配送服务时的安全性，公司采取了一系列防疫措施，其中包括对配送箱进行彻底的消毒处理，并在每周定期对配送员进行体温检测和消毒操作，以保证产品的卫生安全。因此，用户可以放心使用朴朴配送服务，享受快捷、安全和卫生的配送体验。