如果说是你自己家里的违章建筑，应该是有影响的，如果是小区物业管理委员会决定的，为了方便广大居民休闲娱乐的，这与办理产权证应该没有关系，房屋产权证属于你个人的部分，你自己去办理，应该没问题，如果是你住一楼，在一楼的院子里建了休闲纳凉亭，也许就会对你的房产证有影响，因为属于违章建筑，其他的业主会有意见，物业管理公司也不会同意，你想去办证，可能就有些麻烦，如果是公共的建筑，与你个人办产权证应该没有关系，