宜兴农商行代扣学费是通过与学校合作，在学生填写代扣授权书后，通过银行自动转账的方式实现的。学生需要提供相关信息和银行账户信息，授权学校将学费直接从银行账户扣除。宜兴农商行作为银行服务提供商，负责处理学校和学生之间的代扣转账业务，保证交易的安全和高效。

这种代扣方式方便了学生缴费，减少了学校的管理成本，提高了交易效率，同时也为银行和学校带来了商业机会。