孙悟空在《西游记》中遇到的九九八十一难包括：

1、金蝉遭贬：唐僧的前世金蝉子因犯错被贬下凡间。

2、出胎几杀：唐僧出生时差点被杀。

3、满月抛江：唐僧满月时被抛入江中。

4、寻亲报冤：唐僧寻找父母并报冤。

5、出城逢虎：唐僧出城时遇到老虎。

6、落坑折从：唐僧掉入坑中，随从被压死。

7、双叉岭上：唐僧在双叉岭上遇到困难。

8、两界山头：唐僧过了两界山。

9、陡涧换马：唐僧在陡涧换马时遇到白龙。

10、夜被火烧：唐僧在夜晚被火烧。

11、失却袈裟：唐僧的袈裟被偷。

12、收降八戒：唐僧收服猪八戒。

13、黄风怪阻：唐僧遇到黄风怪的阻挠。

17、请求灵吉：唐僧请求灵吉菩萨帮助。

15、流沙难渡：唐僧在流沙河难以渡过。

16、收得沙僧：唐僧收服沙僧。

17、四圣显化：四圣帮助唐僧显化。

18、五庄观中：唐僧在五庄观中遇到困难。

19、难活人参：唐僧试图救活人参果树。

20、贬退心猿：唐僧将孙悟空贬回花果山。

21、黑松林失散：唐僧和孙悟空在黑松林中失散。

22、宝象国捎书：唐僧在宝象国捎书。

23、金殿变虎：唐僧在金殿变成老虎。

24、平顶山逢魔：唐僧在平顶山遇到妖魔。

25、莲花洞高悬：唐僧在莲花洞遇到。