是的，沉降菌和浮游菌可以同时进行。沉降菌主要存在于底层或沉积物中，使用溶解有机物和废弃物来生长和存活。而浮游菌则主要存在于水体表层和底层水层中，利用水中悬浮的有机物和废弃物来生长繁殖。

这两种菌群在自然界中同时共存，并且相互促进，从而一起协同地调节水体生态系统的平衡和稳定性。

但是，如果水体中废水过多或富营养化程度过高，就会导致沉降菌和浮游菌的数量迅速增加，引起藻华、赤潮等水生生物灾害。