社保稽查科是由人力资源和社会保障部门负责管理的。人力资源和社会保障部门是国家机构，主要负责制定和实施劳动力和社会保障政策，保障劳动者的权益，维护社会稳定。

社保稽查科作为其中的一个重要部门，负责监督和管理社会保障制度的实施，对企业和个人的社会保险缴费情况进行调查和稽查，保障社会保障制度的公平、公正和合法性。因此，社保稽查科是由人力资源和社会保障部门管辖的。