北京大学深圳医院距离深圳火车站（位于深圳市罗湖区建设路1001号）最近，距离7933米，附近有多条公交线路可乘坐至火车站西广场，然后步行至火车站，有直达公交，还可以在附近的莲花北村乘坐深圳地铁4号线龙华线，然后换乘地铁1号线罗宝线前往。