如果车辆自燃，通常情况下应该向保险公司申请赔偿。保险公司会根据保险合同的条款，对车辆自燃造成的损失进行赔偿。而4S店一般只负责车辆的维修和保养，不承担车辆自燃的责任。因此，为了获得合理的赔偿，车主应该及时联系保险公司，并按照其要求提供相关的证明材料和信息。