上海公积金余额可以用于购买首套房的首付款，但需要先通过公积金贷款申请审核。公积金贷款的额度通常为总房款的70%至80%，根据贷款额度和房价计算出的首付金额需要自有资金支付或者通过其他方式借款支付。在还款期间，公积金贷款会自动扣除每月还款金额，直至贷款结清。因此，公积金余额虽然可以用于首付款，但具体用途需要看个人的贷款申请和审批情况。