办理港澳通行证签注需要一定的时间，通常需要在空证的基础上提交新的申请，具体的办理时间根据个人情况和申请人数而定。一般来说，如果申请人材料齐全，审批流程顺利，办理时间可在1-2周内完成。因此如果需要再办签注，建议提前规划好行程，留出充足的时间进行申请和审核。