甲酸甲酯和乙酸甲酯都是有机化合物，它们的区别在于分子结构中的碳原子数量和官能团类型。

甲酸甲酯，又称蚁酸甲酯，是一种无色透明液体，有特殊刺激气味。它由甲酸和甲醇在酸性催化剂作用下反应生成。甲酸甲酯分子中含有醛基（—CHO）和醇基（—OH），因此具有醛和醇的性质。

乙酸甲酯，也称醋酸甲酯，是一种无色透明、有特殊香味的液体。它是由甲醇和乙酸在酸性催化剂作用下反应生成的。乙酸甲酯分子中只含有酯基（—COO—），因此具有酯的性质。

此外，在化学性质上，甲酸甲酯的酸性和碱性都比乙酸甲酯强，因为它的分子结构中既有醛基又有醇基，可以发生多种化学反应。而乙酸甲酯的化学性质相对简单，主要是在碱性条件下水解生成甲醇和乙酸。

在实际应用中，甲酸甲酯和乙酸甲酯都有广泛的用途。例如，甲酸甲酯是一种常用的香料和有机合成中间体，可用于合成其他有机化合物；乙酸甲酯则是一种重要的工业溶剂，可用于生产涂料、油漆等产品。

总之，甲酸甲酯和乙酸甲酯在化学结构、性质和应用方面都有明显的区别。