九所新区和九所镇在地理位置、行政区域、经济发展和人口数量等方面存在一定的差异。

首先，九所新区位于乐东黎族自治县西南部，东部与三亚市崖城镇交界，南临大海，西部与利国镇相邻，北部与千家镇相连。而九所镇则隶属于乐东黎族自治县，地处乐东黎族自治县西南部，全镇行政区域面积198.7平方千米。

其次，九所新区是海南省重点城镇建设示范区，有着优越的地理条件和较好的经济条件，是乐东县政治、经济、文化以及物流与信息中心。而九所镇则是一个基层政权机构，设立九所镇是为了更好地服务当地居民。

此外，九所新区和九所镇的经济发展也有所不同。九所新区具有交通优势，有高速公路、西线国道和铁路贯穿东西，还有南距三亚国际机场60公里等便利条件，因此有着较为发达的物流和信息中心。而九所镇则以农业为主导产业，同时发展一些工业企业和服务业。

最后，九所新区和九所镇的人口数量也有差异。九所新区的人口数量相对较多，而九所镇的人口数量相对较少。

综上所述，九所新区和九所镇在地理位置、行政区域、经济发展和人口数量等方面存在一定的差异。