应急管理局的安全员证和建设厅的证书，两者都是各自领域内的重要资格认证，但它们的适用范围和职责有所不同，因此无法简单地说哪个“更好”。

应急管理局的安全员证主要针对应急管理领域，持有该证书的人员通常具备应急管理的专业知识和技能，能够熟练掌握应急预案编制、应急演练、事故调查等工作，并具备一定的沟通协调和应对突发事件的能力。在企事业单位中，持有应急管理局安全员证的人员可以负责组织和实施应急管理工作，提高企业安全管理水平，保障生产安全和员工的生命财产安全。

而建设厅的证书则主要关注住房和城乡建设领域。以新疆维吾尔自治区住房和城乡建设厅为例，它负责贯彻执行国家关于建设事业的方针、政策和法律、法规，指导和监督相关工作的实施，并对全区建设事业进行行业管理。其颁发的证书通常与建筑行业紧密相关，如特种作业证书等，这些证书对于在建筑行业从事相关工作的人员来说具有重要的意义。

因此，选择哪个证书主要取决于个人的职业发展方向和兴趣所在。如果你对应急管理领域感兴趣，想要在这个领域发展，那么应急管理局的安全员证可能更适合你；而如果你更关注建筑行业的发展，那么建设厅的证书可能更符合你的需求。

需要注意的是，无论选择哪个证书，都需要具备一定的专业知识和实践经验，并通过相应的考试或认证程序才能获得。同时，随着行业发展和政策变化，证书的要求和适用范围也可能会有所调整，因此建议在选择证书前仔细了解相关政策和要求，确保自己的选择符合个人职业发展规划。