申请工伤认定通常不需要公司出具证明。根据中国的《工伤保险条例》规定，工伤是指在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害或者患病的。如果员工在工作中受伤或患病，企业应当及时向当地的劳动保障部门或相关部门报告，并根据其提供的病历、诊断证明等证据协助员工进行工伤认定。

不过，企业在员工发生工伤后，应当及时向当地劳动保障部门或相关部门提交工伤认定申请和相关证明材料，并提供必要的医疗救治和赔偿服务。如果企业未在规定时限内提交工伤认定申请或其他证明材料，可能会影响员工的权益。因此，企业在遇到员工受伤或患病时，应当及时采取相应措施并保存好相关证据和证明材料