对于多层别墅的水路设计，最佳方案应该是采用水力平衡管道系统。该系统可以控制水压稳定，同时减少管道噪音和管路阻力。此外，系统还应该考虑到水管的尺寸、斜率和流速等参数，以确保水流畅顺。

在安装水路设施之前，还应该进行严格的水压测试和水质检测，以确保住户的安全和居住舒适度。