根据提供的信息，剧版《武庚纪》的大结局主要涉及以下几个方面：

黑龙的离开：

在神域一战中，黑龙因为白龙的死而心灰意冷，最终被神眼利用结晶山的力量击败。但黑龙并未真正死亡，而是选择离开，寻找地方回忆人生。后来，黑龙王者归来，认可了阿狗的能力，并将世界的管理权交给了阿狗。