若公司在员工手册或合同中有规定扣除旷工工资的权利，并已告知员工相关规定，则扣除900元可能是合法的。但如果公司未提前告知员工这样的规定，且没有法律依据支持，员工可以通过法律途径申诉维权。建议员工在入职前认真阅读公司的员工手册或合同，并了解拥有哪些权利和义务。