是的，您可以使用支付宝支付香港城巴B5路的费用。支付宝（香港）已与所有专营巴士公司达成合作协议，并已于部分九巴、新巴、城巴和新大屿山巴士上安装二维码收款系统。您需要注意的是，虽然可以多种电子支付方式乘坐城巴，但在一条线路上不能同时使用两种电子货币进行支付。